疯狂动物园中隐藏着众多稀有且神秘的未知生物，它们通常需要特定条件或技巧才能触发出现。这些生物不仅外观独特，还具备特殊能力，为游戏增添了探索乐趣。例如暗黑野牛需要玩家骑乘同一只野牛不换乘跑完800米才会现身，而特洛伊斑马则要求连续换乘草原地图上的7种不同动物才能解锁。这类隐藏动物的出现机制往往与地图特性、骑乘行为或任务进度紧密相关，玩家需结合环境与操作技巧进行针对性尝试。
部分隐藏生物的出现依赖于复杂的连锁反应。鸭嘴河马可通过两种方式触发：其一是用河马持续前进1000米以上，其二是用同一只河马在不换乘状态下撞击四只同类。三嘴鸟则需要玩家骑乘大嘴鸟完成90至100米的高空跳跃换乘后才会出现，这种操作对时机把控有较高要求。恐龙犀牛隐藏在丛林地图中，需连续换乘七种不同动物才会登场，而纯黑鹿则需在山脉以外的地图连续换乘八种动物。这些设计体现了游戏对玩家操作连贯性和地图熟悉度的考验。
极地区域隐藏着更具挑战性的生物，如机械狐狸需骑乘同一只狐狸跑完1500米，雪兔要求连续换乘六只北极兔。剑齿海象出现在2000米后的超大石块区域，玩家需从高处跳下才能触发。澳洲地图的变色骆驼需要混合换乘七种澳洲动物和一种外来动物，而炸弹袋熊则需用袋熊一次性撞击四只动物。这些条件往往需要玩家反复尝试才能掌握精确的触发阈值。
希腊奥林匹斯山等特殊地图中的隐藏生物设计更为复杂。后知后觉鹿需骑乘牝鹿跑完1200米，三头凤凰要求用狮鹫在一局内吞食三只凤凰。迷宫牛头人需凤凰撞击两只牛头人才能召唤，健身霸王龙则通过收集五个恐龙蛋随机出现。这类生物常与地图主题呼应，其解锁条件往往需要玩家理解地图机制并组合多种操作。
探索隐藏生物的核心在于系统性观察与记录。玩家应关注动物行为模式与地图环境细节，例如罗宾汉鹰需沿跑道边缘灌木丛方向飞出至最远山峰，蒸汽朋克牦牛要求撞飞十只动物且复活不会重置计数。部分生物如骷髅象、外星长颈鹿等需通过随机BOSS任务解锁，这要求玩家保持任务进度与地图探索的平衡。持续积累操作经验与社区信息共享是高效发现隐藏生物的关键。
